Investigadores del Instituto de Salud Carlos III han conseguido el primer borrador de la secuencia completa del virus causante de la viruela del mono (Monkey Pox) que circula por España a partir de las muestras de 23 pacientes.
Lo ha logrado un equipo del Laboratorio de Arbovirus y de las Unidades de Genómica y Bioinformática de este Instituto -dependiente del Ministerio de Ciencia e Innovación- y el avance permitirá hacer análisis más avanzados para obtener datos sobre su comportamiento y comprender mejor su origen, circulación y difusión.
La secuenciación completa ha confirmado que el virus de la viruela de los monos del brote que se está produciendo en España pertenece a un grupo fitogenético de África Occidental, que es el de menor virulencia entre los conocidos y el que se ha identificado por el momento en la mayoría de los países fuera de África implicados en este brote.
Según ha informado el Instituto de Salud Carlos III, se trata de una de las secuencias más completas que se han obtenido hasta el momento, y ha permitido además alcanzar una cobertura del 100 por cien de los 190.000 pares de bases del genoma de este virus.
La secuenciación llevada a cabo a través del Laboratorio de Arbovirus del ISCIII, en colaboración con las unidades de Genómica y Bioinformática, ha contado con las referencias publicadas en los últimos días por otros países (Bélgica, Alemania, Portugal y EEUU), y se ha basado en una tecnología genómica de nueva generación.
A esa tecnología se ha sumado un análisis complementario de las muestras mediante una técnica conocida como "ensamblado de novo", ha precisado el Instituto.
Las secuencias en crudo se terminaron de obtener el pasado lunes por la noche y el análisis de computación se ha completado en las últimas 36 horas.
Los resultados señalan que las muestras secuenciadas parecen pertenecer al mismo brote detectado en otros países europeos, ya que los genomas obtenidos apenas difieren de los ya secuenciados en otros países; en concreto, el análisis realizado en el ISCIII concluye que hay muy pocas diferencias respecto a la secuenciación llevada a cabo en Alemania.
La secuenciación confirma que el virus de la viruela de los monos del brote que se está produciendo en España pertenece al "clado" -variante- de África Occidental.
Los "clados", ha informado el Instituto, son grupos filogenéticos que definen la evolución biológica de un organismo, que explican cómo actúa y se comporta, y en ellos se pueden observan las diferencias genéticas de los virus circulantes.
Tras obtener la secuencia completa del virus, varios equipos de investigadoras del ISCIII están ahora llevando a cabo análisis filogenéticos para conocer la relación entre las muestras españolas y las de otros países.
La información que obtengan se enfrentará a las ya conocidas y depositadas en bases de datos internacionales para evaluar el grado de identidad y, en su caso, la localización de las diferencias que pudieran existir entre la secuencia española y los demás datos internacionales.
Toda esta información, ha destacado el Instituto, permitirá realizar los estudios de trazabilidad del brote, así como identificar potencialmente su origen.
171 casos notificados a nivel internacional
Los casos confirmados de viruela del mono afectan ya a diversos países del mundo: en su último informe, con fecha del miércoles, 25 de mayo, el Ministerio de Sanidad español cifraba en 171 los casos notificados a nivel internacional.
Entre los más afectados, según las cifras que maneja el Departamento que dirige Carolina Darias, se encuentra precisamente España, que acumula hasta el momento 59 casos de viruela no humana -20 de ellos positivos en viruela del mono y los demás, a la espera de secuenciación-.
El país que más casos acumula por el momento, según esta misma fuente, sería Reino Unido, con 71 casos de 'monkeypox', seguido de nuestro país y, en tercer lugar, Portugal, que contabiliza 37.
Sanidad recoge en el citado informe casos también en Alemania (4), Argentina (1), Australia (2), Austria (1), Bélgica (4), Canadá (15), Dinamarca (1), Emiratos Árabes (1), Estados Unidos (8), Eslovenia (1), Francia (5), Israel (2), Italia (5), Marruecos (3), Países Bajos (6), República Checa (1), Suecia (1) y Suiza (2).
En cuanto a nuestro país, los 59 casos confirmados y las decenas que se están analizando afectan a nueve comunidades autónomas, con el brote más importante aún en Madrid. En las últimas horas, Extremadura ha descartado la infección de una paciente, mientras que Aragón (1) y Euskadi (2) comunicaron este miércoles infecciones por 'monkeypox'.
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La Comunidad de Madrid, con al menos 51 casos, registra hasta el momento el mayor brote, y fue, junto con Canarias, la primera que alertó de las infecciones. Galicia, la Comunitat Valenciana, Castilla-La Mancha, Andalucía y Castilla y León, por su parte, siguen pendientes de confirmar las muestras sospechosas de pacientes con síntomas compatibles.