Ángel María Villar ha protagonizado muchas polémicas desde su llegada a la RFEF. Equipo de Investigación, en laSexta, ya emitió un reportaje en el que desgranó cómo funciona la Federación y hasta dónde llega el poder del presidente de la Federación.
Muchos han sido los desencuentros de Villar con la prensa, aunque el presidente de la RFEF protagonizó otro con laSexta el pasado mes de mayo, cuando se negó a hablar alegando que "en laSexta no hablo, allí siempre me ponen a parir".
Ángel María Villar acudió a su juicio contra Jorge Pérez y se mostró tan reacio a hablar con los medios como de costumbre. El presidente de la RFEF sólo dedicó unos segundos en responder a un periodista de 'Onda Cero', al que mandó "a freír puñetas".
Además, Jugones ha denunciado las polémicas informaciones que han surgido alrededor del hasta ahora presidente de la Federación.
Una de sus últimas polémicas con los medios también surgió cuando fue preguntado por el caso Cristiano.