DECLIVE GENÉTICO
Secuenciado el genoma del leopardo de Arabia
Un equipo internacional liderado por el Instituto de Biología Evolutiva ha identificado indicios de declive genético en el genoma de este animal. La investigación ha logrado reunir la mayor base de datos genómicos de este félido hasta la fecha, que incluye la secuenciación de novo del genoma completo de dos leopardos de Arabia.
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El leopardo es una de las especies más icónicas y reconocibles en la actualidad. Se trata de un depredador que a lo largo de la historia ha logrado adaptarse a un gran número de ecosistemas distintos en África, Europa y Asia. Pese a ser tan emblemática, la realidad es que conocemos muy poco sobre esta especie. De entre sus ocho subespecies actuales, una de las menos estudiadas es el leopardo de Arabia (Panthera pardus nimr).
Esta subespecie, en peligro crítico de extinción, cuenta con tan solo 250 ejemplares que se distribuyen a lo largo de Arabia Saudí, Yemen y el sur de Omán. Sin embargo, debido a su situación geográfica entre los dos principales clados de leopardos (África y Asia), se trata de una población clave para entender la historia evolutiva de estos felinos.
Ahora un equipo internacional liderado por el Instituto de Biología Evolutiva (IBE), un centro mixto del Consejo Superior de Investigaciones Científicas y la Universidad de Pompeu Fabra, ha compilado la mayor base de datos genómicos del leopardo hasta la fecha. El equipo ha analizado el genoma completo de dos ejemplares de leopardo de Arabia y arroja datos preocupantes sobre su declive genético.
La investigación clarifica la historia evolutiva del leopardo, y confirma que el leopardo de Arabia es una subespecie genéticamente distinta y al borde de la extinción. El estudio también sienta las bases para conservar las poblaciones de este felino amenazado con la ayuda de la información genómica disponible.
Los análisis genómicos del ADN nuclear de dos individuos sugieren que el leopardo de Arabia es un grupo hermano de los leopardos asiáticos. Con ello el estudio contradice investigaciones anteriores basadas en el análisis de ADN mitocondrial, más corto y de herencia exclusivamente materna, que habían observado un mayor parentesco con el leopardo africano - el otro clade mayoritario. Los resultados del estudio sugieren que el leopardo de Arabia pudo iniciar la expansión del leopardo después del "Out-of-Africa" hacia el resto del continente asiático y tal vez Europa.
El análisis del parentesco ha confirmado que el leopardo de Arabia es una subespecie genéticamente distinta, lo cual es de particular importancia para dirigir los esfuerzos para su conservación.
El declive de la especie reflejado en sus genes
El equipo ha identificado claros signos de extinción en los genes del felino. "La mayor amenaza para el futuro de una especie es la pérdida de diversidad genética", apunta Salvador Carranza, responsable del estudio e investigador principal del IBE. "Las poblaciones del leopardo de Arabia son cada vez menores y su alto grado de aislamiento ha provocado la endogamia dentro de las mismas, poniendo en peligro su viabilidad", añade.
De acuerdo con el estudio, la falta de diversidad genética observada es el resultado de declives poblacionales recientes.
"Estos pudieron ser causados por la aridez del entorno y la actividad humana, que ha provocado una degradación de su hábitat", añade Gabriel Mochales, primer autor del estudio e investigador predoctoral en el IBE. Los niveles de diversidad genética de los individuos analizados sitúan a esta subespecie arábiga cerca del asiático leopardo de Java (Panthera pardus melas), una pequeña población caracterizada por su estricto aislamiento insular. "La ausencia de diversidad genética hace que la población sea más vulnerable a los cambios ambientales o la emergencia de nuevas enfermedades, como el covid", comenta Mochales.
En el estudio ha participado el grupo de genómica comparativa, liderado por el profesor ICREA Tomàs Marquès-Bonet del IBE, también catedrático de la UPF.
Sin genómica no hay conservación
En la actualidad, están en marcha diversos programas de conservación del leopardo en la Península Arábiga. Sin embargo, estos programas de cría en cautividad no están teniendo en cuenta datos genómicos. "Con este estudio, hemos sentado las bases de una estrategia de conservación informada genómicamente para el leopardo árabe en peligro crítico", afirma Carranza, investigador principal del grupo de Sistemática, biogeografía y evolución de reptiles y anfibios.
"Los análisis genéticos en poblaciones amenazadas son imprescindibles para evaluar su vulnerabilidad a la extinción y gestionar acciones de conservación", añade Mochales.
"En el futuro, esfuerzos para la secuenciación de todas las especies y subespecies, como el promovido por elEarth Biogenome Project (EBP), elEuropean Reference Genome Atlas (ERGA) y el Catalan Biogenome Project (CBP), serán claves para proteger el patrimonio mundial que representan todos los genomas del planeta", concluye Carranza.
Referencia:
Salvador Carranza et al. "Genomics reveals introgression and purging of deleterious mutations in the Arabian leopard". [[LINK:EXTERNO|||%20https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.107481|||iScience]]
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