La entidad española podría realizar actividades como las siguientes:
1- Financiar, a través de convocatorias competitivas, las actividades de investigación y formación de una manera más rápida y transparente que la actual.
2- Diseñar actuaciones de apoyo, difusión y evaluación de la investigación científica española.
3- Asesorar a las instituciones para definir políticas de estímulo y apoyo a la ciencia.

La misión de esta nueva Agencia, por tanto, sería la de promover la máxima calidad investigadora a través de financiación competitiva, en base a la excelencia científica.
La AEI supondrá, sin lugar a dudas, un avance para nuestro país, y pondrá la primera piedra para conseguir un sistema económico basado en el conocimiento.