Sus ingresos no cuadraban con lo que declaró en la amnistía fiscal y eso puso el foco de la investigación en la fortuna familiar. Un emporio por el que su padre tuvo problemas con la justicia durante el franquismo.
En 1966, Ramón Rato fue condenado a tres años de cárcel por evadir dinero español a Suiza a través de una filial de su Banco de Siero.
También estuvo en prisión su hermano que llegó a dirigir más de cincuenta empresas familiares, incluida la cadena de radio que llevaba su nombre, 'Cadena Rato'.